Hậu Duệ Mặt Trời xoay quanh hai nhân vật chính là Yoo Shi Jin và Kang Mo Yeon. Yoo Shi Jin là đội trưởng của lực lượng gìn giữ hòa bình thuộc Liên Hợp Quốc, trong khi Kang Mo Yeon là một thành viên của tổ chức Bác sĩ không biên giới.
Trong những ngày đầu gặp gỡ và hợp tác, giữa Yoo Shi Jin và Kang Mo Yeon thường xảy ra nhiều xung đột do tính cách và quan điểm khác nhau. Tuy nhiên, theo thời gian, mối quan hệ giữa họ dần trở nên tốt đẹp hơn. Họ đã cùng nhau vượt qua nhiều thử thách và hiểm nguy trong cuộc sống.
Những trải nghiệm chung đã giúp họ nhận ra tình cảm thật sự mà họ dành cho nhau. Mối tình của họ không chỉ là sự tvhay kết hợp giữa hai con người với những công việc khác nhau mà còn là một hành trình tìm kiếm và khám phá bản thân trong những tình huống khó khăn.
Hậu Duệ Mặt Trời không chỉ đơn thuần là một bộ phim tình cảm, mà còn mang đến những thông điệp sâu sắc về tình yêu, sự hy sinh và trách nhiệm. Qua từng tập phim, khán giả sẽ cảm nhận được sự phát triển của nhân vật cũng như những bài học quý giá mà cuộc sống mang lại.